二十世紀初的日本太正時代自明治維新以來的文明開化已進行了五十余年　　隨著西洋文化和日本傳統文化的交匯融合帝都·東京逐漸成為現代化建筑鱗次櫛比蒸汽鐵道、地下鐵道縱橫交錯馬車、人力車、蒸汽車川流不息的繁華都市然而這也是一座有著怪物和咒術等非現實存在的魔幻都市　　為了對抗從地底出現的強大魔物“降魔”陸軍成立了由將校中的靈能者組成的特殊部隊——對降魔部隊成員即“二刀二劍”的4位繼承者：米田一基持有 “神刀·滅卻”；山崎真之介持有“光刀·無形”；藤枝菖蒲持有“神劍·白羽鳥”；真宮寺一馬持有“靈劍·荒鷹”四人僅憑自己的血肉之軀和手中的神劍與魔物作戰史稱“降魔戰爭”激戰的結果陷入絕境的對降魔部隊被迫使出最后的手段——利用“魔神器”發動“破邪之血”魔神器即日本上古時代流傳下來的三種祭器：劍、珠、玉可以成為魔力的增幅器繼承真宮寺家“破邪之血”的一馬以自己的生命為代價用魔神器將降魔們封印而山崎真之介也在此戰中失蹤……　　太正十一年以妖僧天海為首的邪惡組織“黑之巢會”蠢蠢欲動仇視近代文明的天海為了復辟德川幕府的統治率領手下的死天王葵叉丹、彌勒、修羅、羅剎操縱著利用古代咒法生出的魔物——魔操機兵在帝都展開了破壞活動為了對抗這新的威脅、守護帝都和民眾在花小路伯爵的大力支持下新的政府直屬對降魔組織——帝國華擊團（簡稱“帝擊”）·花組成立了在米田一基、藤枝菖蒲的領導下花組集結了6名具備高靈力的少女：真宮寺一馬的女兒、靈劍·荒鷹的繼承者真宮寺櫻；神崎財閥總帥忠義的孫女、精通神崎風塵流長刀術的神崎堇；俄國革命的勇士、曾有“食火鳥”之稱的瑪麗亞·橘；自幼就因超常的靈力被與世隔絕、年僅10歲的法國貴族千金愛麗絲；在辛亥革命的戰亂中失去親人、精通機械的中國少女李紅蘭；以及桐島流空手的正統傳人、身高近 2米的桐島神奈同時基于山崎真之介留下的設計由神崎重工完成了對降魔用靈子甲胄“光武”以銀座大帝國劇場為基地、平日以歌劇團面目出現來掩人耳目的花組在魔物出現時就會變為守護帝都的戰士駕駛光武與敵人作戰　　太正十二年春苦于戰力及協作性不足的花組來了一位新隊長——海軍少尉大神一郎《櫻花大戰》的故事也就從這里開始了……