女媧大神為了造福蒼生而創造的神兵獸在新一輯故事中再次面臨挑戰黑暗勢力元始天魔千方百計將神兵小將和神獸引領到神秘島國——「山外山」；天魔希望利用神兵小將的純潔和正義獲得「山外山」五大守護圣獸的信任將其圣潔的力量交予問天和天晶獸；然后再指使大壞蛋——無敵盟主看準時機從他們身上奪取圣獸的力量以解除封印美麗的宇宙隨即陷入被毀滅的恐慌之中　　在「山外山」旅程后「神獸之鄉」的旅程又拉開帷幕問天等人來到神獸學校修煉居然卷入了一場布偶戰爭之中——布偶王子想讓所有神獸變成木偶可是經過詳細的調查發現外表邪惡來自于布偶樂園的布偶王子竟是寬容與純真的兄弟幕后主使的壞蛋三兄弟和蓋世太保（把寬容等人的三兄弟分散的邪惡神獸）在布偶王子背叛他們后趁機綁架布偶王子他們一行人又怎么克服此次困難呢